儿童如果长期便秘，由于食物糟粕长时间积滞于肠道内，在肠道细菌的作用下发酵、腐败，大量的有害气体从有毒物质，经肠壁吸收后进入血液中，经出循环系统到达各个器官。毒素侵及大脑，使脑神经受到恶性刺激，会妨碍脑神经的正常功能，不仅会导致记忆力下降，而且可能影响到逻辑思维能力和创造思维能力;有便秘史的儿童，由于膨胀的直肠经常压迫膀胱壁，可引起膀胱容量的减小，白天可出现尿频，夜间则易发生遗尿。如果是上学的孩子，则会为了控制频繁上厕所，而自觉限制饮水，从而又加重便秘，如此恶件循环，这是儿童便秘不易纠正的原因之一。另一方面，夜间遗尿会加重儿童心理负担，家长或责备或发愁，并不知道纠正患儿便秘亦可治愈其遗尿。国外学者认为专家发现患仑便秘的儿童中有遗尿症的比例很大，报道调查了25例遗尿儿童，其中竞有22例是持续便秘者。